MundRaub

Nerdtalk mit Sergius

Nerdiger Talk über aktuelle Themen zu HPC und Maschinellem Lernen mit Sergius Siczek von sysGen. Hier unterhalten sich einfach zwei Technik-Enthusiasten, es handelt sich nicht um Werbung für irgendeine Firma. Wir haben das alles unbezahlt in unserer Freizeit gemacht! Viel Spaß beim Hören. Danke an Mino und Cono Bender für ihr tolles "Und jetzt ist Schluss". Soundtrack und Produktion: Dr. Stephan Raub

Überwachung der Ausbreitung von SARS-CoV2 (Prof. Dr. Alexander Dilthey und Dr. Torsten Houwaart)

Prof. Dr. Alexander Dilthey und Dr. Torsten Houwaart erzählen darüber, wie sie durch bioinformatische Methoden die Spur von SARS-CoV2 nach Deutschland nachverfolgen konnten, wie sie jetzt die Varianten-Überwachung im Raum Düsseldorf machen und warum man dafür sowohl Maschinelles Lernen als auch High-Performance-Computing braucht. Artikel: Andreas Walker, Torsten Houwaart2, Tobias Wienemann, Malte Kohns Vasconcelos, Daniel Strelow, Tina Senff, Lisanna Hülse, Ortwin Adams, Marcel Andree, Sandra Hauka, Torsten Feldt, Björn-Erik Jensen, Verena Keitel, Detlef Kindgen-Milles, Jörg Timm, Klaus Pfeffer, Alexander T Dilthey: "Genetic structure of SARS-CoV-2 reflects clonal superspreading and multiple independent introduction events, North-Rhine Westphalia, Germany, February and March 2020", Euro Surveill., 2020;25(22):pii=2000746. DOI: 10.2807/1560-7917.ES.2020.25.22.2000746 [https://doi.org/10.2807/1560-7917.ES.2020.25.22.2000746] Andreas Walker, Torsten Houwaart, Patrick Finzer, Lutz Ehlkes, Alona Tyshaieva, Maximilian Damagnez, Daniel Strelow, Ashley Duplessis, Jessica Nicolai, Tobias Wienemann, Teresa Tamayo, Malte Kohns Vasconcelos, Lisanna Hülse, Katrin Hoffmann, Nadine Lübke, Sandra Hauka, Marcel Andree, Martin P Däumer, Alexander Thielen, Susanne Kolbe-Busch, Klaus Göbels, Rainer Zotz, Klaus Pfeffer, Jörg Timm, Alexander T Dilthey, German COVID-19 OMICS Initiative (DeCOI): "Characterization of SARS-CoV-2 infection clusters based on integrated genomic surveillance, outbreak analysis and contact tracing in an urban setting", Clinical Infectious Diseases, 2021; ciab588, DOI: 10.1093/cid/ciab588 [https://doi.org/10.1093/cid/ciab588] Informationen zu Prof. Dr. Alexander Dilthey: https://www.uniklinik-duesseldorf.de/patienten-besucher/klinikeninstitutezentren/institut-fuer-medizinische-mikrobiologie-und-krankenhaushygiene/forschung-arbeitsgruppen/dr-alexander-dilthey [https://www.uniklinik-duesseldorf.de/patienten-besucher/klinikeninstitutezentren/institut-fuer-medizinische-mikrobiologie-und-krankenhaushygiene/forschung-arbeitsgruppen/dr-alexander-dilthey] Informationen zu Dr. Torsten Houwaart: https://www.researchgate.net/scientific-contributions/Torsten-Houwaart-2064287257 [https://www.researchgate.net/scientific-contributions/Torsten-Houwaart-2064287257] Offizielle Informationen über SARS-CoV2 des Bundesministeriums für Gesundheit [https://gesund.bund.de/covid-19]. Danke an Mino und Cono Bender für ihr tolles "Und jetzt ist Schluss". Soundtrack und Produktion: Dr. Stephan Raub

Kampf gegen SARS-CoV-2 mit Supercomputern (mit Prof. Dr. Birgit Strodel)

Prof. Dr. Birgit Strodel erzählt wie sie und ihr Team mit Hilfe unseres Supercomputers "HILBERT" [https://www.zim.hhu.de/high-performance-computing.html] an der Heinrich-Heine-Universität [https://www.hhu.de/] mögliche Wirkstoffe gegen COVID-19 entdeckt. Prof. Dr. Birgit Strodel: http://www.strodel.info/strodel.php [http://www.strodel.info/strodel.php] Artikel: * O. O. Olubiyi, M. Olagunju, M. Keutmann, J. Loschwitz, B. Strodel, "High  Throughput Virtual Screening to Discover Inhibitors of the Main Protease  of the Coronavirus SARS-CoV-2". Molecules. 2020 Jul 13;25(14):3193. DOI:10.3390/molecules25143193 [https://doi.org/10.3390/molecules25143193] * O. O. Olubiyi, J. Loschwitz, M. Olagunju, M. Keutmann, A, Jäckering, R. Erberle, M. Coronado, B. Strodel, "Novel inhibitors of the main protease enzyme of SARS-CoV-2 identified via molecular dynamics simulation-guided in vitro assay", to be published Offizielle Informationen über SARS-CoV2 des Bundesministeriums für Gesundheit [https://gesund.bund.de/covid-19]. Danke anMino und Cono Bender für ihr tolles "Und jetzt ist Schluss". Soundtrack und Produktion: Dr. Stephan Raub